Η ΑΕΚ είναι η πρώτη ελληνική ομάδα που κατέκτησε ευρωπαϊκό τίτλο. Το τμήμα μπάσκετ της Ένωσης δημιουργήθηκε το 1924 παράλληλα με την ίδρυση του συλλόγου και συμμετείχε στο πρώτο Πανελλήνιο Πρωτάθλημα που διοργανώθηκε υπό την αιγίδα του ΣΕΓΑΣ το 1928.

Από τότε και μέχρι το 1948 η δράση της ομάδας μπάσκετ της ΑΕΚ σταμάτησε. Με πρωτοβουλία του εφόρου Χρήστου Λιάσκου και των αθλητών Παναγιώτη Ευαγγελάτου, Τάκη Μανάρα και Γιάννη Βεζυργιάννη, το τμήμα επανασυστάθηκε και ξεκίνησε από την τελευταία κατηγορία.

Το 1951 η απόκτηση του Κώστα Καραμανλή από τον Ηρακλή έδωσε ώθηση στην Ένωση, η οποία την σεζόν 1957-58 προς γενική έκπληξη κατέκτησε το Πανελλήνιο Πρωτάθλημα Ελλάδας. Παίκτες της πρώτης πρωταθλήτριας ομάδας της ΑΕΚ ήταν εκτός από τον αρχηγό Καραμανλή, οι Νίκος Μπαμπανικολός, Ευαγγελάτος, ο αείμνηστος Βαγγέλης Σεβδίνογλου, Βαγγέλης Δερμανούτσος κ.α.

Η συνέχεια ήταν διαρκώς ανοδική και το 1966 η Ένωση μετείχε στο πρώτο Φάιναλ Φορ του Κυπέλλου Πρωταθλητριών Ευρώπης που πραγματοποιήθηκε στο Μιλάνο. Στον χαμένο ημιτελικό με αντίπαλο την Σλάβια Πράγας, φόρεσε για τελευταία φορά την φανέλα της ΑΕΚ ο Γεώργιος Μόσχος, που «έφυγε» από την ζωή τον Δεκέμβριο της ίδιας χρονιάς χτυπημένος από τον καρκίνο.

Την Σλάβια Πράγας συνάντησε ξανά η Ένωση το 1968 στον τελικό του Κυπέλλου Κυπελλούχων Ευρώπης που έγινε παρουσία 100.000 θεατών στο Παναθηναϊκό Στάδιο. Η ΑΕΚ με τη νίκη της με σκορ 89-82 έγινε η πρώτη ελληνική ομάδα που κατέκτησε ευρωπαϊκό τίτλο.

Αρχηγός της Ένωσης ήταν ο αείμνηστος Γιώργος Αμερικάνος με συμπαίκτες τους Γιώργο Τρόντζο, Χρήστο Ζούπα, Αίαντα Λαρεντζάκη, Στέλιο Βασιλειάδη, τον, επίσης, αξέχαστο Αντώνη Χρηστέα κ.α. υπό τις οδηγίες του Νίκου Μήλα, ο οποίος «έφυγε» από την ζωή τον Ιούλιο του 2019.

Η ΑΕΚ έχει κατακτήσει συνολικά 8 Πρωταθλήματα Ελλάδας. Είναι η τέταρτη σε κατακτήσεις τίτλων Πρωταθλήματος Ελλάδας.

Εκτός από το Κύπελλο Κυπελλούχων Ευρώπης του ’68, έχει ακόμη δύο ευρωπαϊκούς τίτλους στην τροποιοθήκη της και το Διηπειρωτικό Κύπελλο, που κατέκτησε το 2019 με νίκη στον τελικό του Φάιναλ Φορ του Ρίο Ντε Τζανέιρο επί της Φλαμένγκο από τη Βραζιλία.

Οι άλλοι δύο ευρωπαϊκοί τίτλοι είναι το Κύπελλο Σαπόρτα, που πανηγύρισε στην Λωζάνη το 2000 με επικράτηση στον τελικό με αντίπαλο την Κίντερ Μπολόνια (83-76) και το Basketball Champions League, που κατέκτησε 50 χρόνια μετά το ’68, τον Μάϊο του ’18, πάλι στην Αθήνα, στο κατάμεστο ΟΑΚΑ με νίκη στον τελικό του Φάιναλ Φορ επί της Μονακό (100-94).